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军机处的主要职能是：军机大臣每日接受皇上召见，跪受笔录，负责皇帝下达谕旨的撰拟和参预官员上报之奏折文书的处理。办理皇帝交议的大政，某些重大案件，皇帝特交军机大臣审理拟定，或由军机大臣会同三法司审拟。军机处的特点是：军机处实行了严格的归档保密规定，办事效率很高。清军机处还设有专门的档案房，有专职的保密人员管理这些档案，由此而使军机处的保密工作做得非常之好，同时，为后代留下了许多难得的珍贵史料。 军机处的建立,标志着我国封建君主集权的进一步强化。是清王朝对中央行政机构的一次重大变革，表现出清代前期政治制度高度集权的趋向。军机处成立以后，逐渐代替了清建国以来所依靠的满洲亲王，贝勒参预议政的制度，废除了议政处；同时也削弱了内阁参预国政的权力。